Iniciado en 1131, bajo el patrocinio de D. Afonso Henriques, y entregó la Orden de San Agustín de Cónegos Regrantes. Entre los que asistieron a la escuela del monasterio, es de San Antonio, que se llevó a las órdenes de Coimbra S. Francisco. La iglesia románica fue el arquitecto francés de Roberto. Obras promovidas por el rey Manuel I, que se asigna a las bóvedas Boitaca capitán, o la notable manuelina puestos en 1513, y cuya coronación se refiere al tema de los Descubrimientos Portugueses. Merecen la misma importancia a la real orden Nicolau Chanterenne a la aplicación de la presente tumbas reales en estilo renacentista.
Afonso Henriques y Sancho I, primer rey de Portugal, sobre la base de elegantes pecho tumba, en el presbiterio de la iglesia, hoy Panteón Nacional.
La fachada del monasterio románico presenta elementos estructurales, en relación con la decoración del portal, el siglo XVI. El arco de triunfo que está por encima de la parte delantera del siglo XIX. En la parte de atrás de todos los monjes, es el Claustro de Manga, hermoso edificio renacentista con una pureza de estilo pocas veces superado. El edificio antes conocido como la Fuente de Manga, estuvo en el centro de uno de los tres claustros del Monasterio de Santa Cruz. El Claustro del Silencio es manuelino del siglo XVI, y tiene cuatro bajo relieves con escenas de la Pasión, escrita por Nicholas Chanterenne.